Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Tns3Q5SSZ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Tns3Q5SSZ5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Tns3Q5SSZ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Tns3Q5SSZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Tns3Q5SSZ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Tns3Q5SSZ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Tns3Q5SSZ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Tns3Q5SSZ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Tns3Q5SSZ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Tns3Q5SSZ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Tns3Q5SSZ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Tns3Q5SSZ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Tns3Q5SSZ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Tns3Q5SSZ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Tns3Q5SSZ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tns3Q5SSZ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tns3Q5SSZ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Tns3Q5SSZ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tns3Q5SSZ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Tns3Q5SSZ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tns3Q5SSZ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tns3Q5SSZ5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tns3Q5SSZ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tns3Q5SSZ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Tns3Q5SSZ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tns3Q5SSZ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tns3Q5SSZ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Tns3Q5SSZ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Tns3Q5SSZ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tns3Q5SSZ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Tns3Q5SSZ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Tns3Q5SSZ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tns3Q5SSZ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Tns3Q5SSZ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tns3Q5SSZ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Tns3Q5SSZ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Tns3Q5SSZ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Tns3Q5SSZ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tns3Q5SSZ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Tns3Q5SSZ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Tns3Q5SSZ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tns3Q5SSZ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Tns3Q5SSZ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Tns3Q5SSZ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Tns3Q5SSZ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Tns3Q5SSZ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Tns3Q5SSZ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Tns3Q5SSZ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Tns3Q5SSZ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Tns3Q5SSZ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Tns3Q5SSZ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Tns3Q5SSZ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Tns3Q5SSZ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Tns3Q5SSZ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Tns3Q5SSZ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Tns3Q5SSZ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Tns3Q5SSZ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Tns3Q5SSZ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tns3Q5SSZ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tns3Q5SSZ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Tns3Q5SSZ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Tns3Q5SSZ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Tns3Q5SSZ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Tns3Q5SSZ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tns3Q5SSZ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
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