Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5730522E02RikQ5SP45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5730522E02RikQ5SP45 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.28■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
5730522E02RikQ5SP45 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730522E02RikQ5SP45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
5730522E02RikQ5SP45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5730522E02RikQ5SP45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5730522E02RikQ5SP45 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5730522E02RikQ5SP45 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5730522E02RikQ5SP45 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5730522E02RikQ5SP45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5730522E02RikQ5SP45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5730522E02RikQ5SP45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
5730522E02RikQ5SP45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5730522E02RikQ5SP45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms