Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Trav2Q5R1I9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,96■□□□□ 0,95
Trav2Q5R1I9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Trav2Q5R1I9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Trav2Q5R1I9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Trav2Q5R1I9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,73■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Trav2Q5R1I9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Trav2Q5R1I9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,6■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Trav2Q5R1I9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,54■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Trav2Q5R1I9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Trav2Q5R1I9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Trav2Q5R1I9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Trav2Q5R1I9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,29■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Trav2Q5R1I9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,28■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms