Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trav6-2Q5R1I4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trav6-2Q5R1I4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trav6-2Q5R1I4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav6-2Q5R1I4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trav6-2Q5R1I4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trav6-2Q5R1I4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trav6-2Q5R1I4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trav6-2Q5R1I4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trav6-2Q5R1I4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trav6-2Q5R1I4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trav6-2Q5R1I4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav6-2Q5R1I4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav6-2Q5R1I4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav6-2Q5R1I4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav6-2Q5R1I4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms