Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a5Q4LDG0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc27a5Q4LDG0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc27a5Q4LDG0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc27a5Q4LDG0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc27a5Q4LDG0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc27a5Q4LDG0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a5Q4LDG0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a5Q4LDG0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc27a5Q4LDG0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc27a5Q4LDG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc27a5Q4LDG0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a5Q4LDG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms