Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lrrc43Q3V0L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrrc43Q3V0L5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Lrrc43Q3V0L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lrrc43Q3V0L5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrrc43Q3V0L5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lrrc43Q3V0L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrrc43Q3V0L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrrc43Q3V0L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lrrc43Q3V0L5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lrrc43Q3V0L5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrrc43Q3V0L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrrc43Q3V0L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrrc43Q3V0L5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrrc43Q3V0L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrrc43Q3V0L5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc43Q3V0L5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrrc43Q3V0L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrrc43Q3V0L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrrc43Q3V0L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lrrc43Q3V0L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc43Q3V0L5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrrc43Q3V0L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lrrc43Q3V0L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc43Q3V0L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc43Q3V0L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc43Q3V0L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lrrc43Q3V0L5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lrrc43Q3V0L5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc43Q3V0L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc43Q3V0L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
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