Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3UZV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UZV7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UZV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UZV7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3UZV7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UZV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UZV7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UZV7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UZV7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3UZV7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3UZV7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3UZV7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3UZV7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3UZV7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3UZV7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q3UZV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3UZV7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3UZV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3UZV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3UZV7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3UZV7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3UZV7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3UZV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3UZV7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3UZV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3UZV7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3UZV7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UZV7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3UZV7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UZV7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3UZV7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UZV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3UZV7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3UZV7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3UZV7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3UZV7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3UZV7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3UZV7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3UZV7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3UZV7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3UZV7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UZV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UZV7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UZV7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UZV7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UZV7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UZV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3UZV7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3UZV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3UZV7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3UZV7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q3UZV7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q3UZV7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q3UZV7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q3UZV7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3UZV7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3UZV7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3UZV7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3UZV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3UZV7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3UZV7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3UZV7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3UZV7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3UZV7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms