Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Prom2Q3UUY6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Prom2Q3UUY6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Prom2Q3UUY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Prom2Q3UUY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Prom2Q3UUY6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Prom2Q3UUY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Prom2Q3UUY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33,66■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Prom2Q3UUY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Prom2Q3UUY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Prom2Q3UUY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Prom2Q3UUY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Prom2Q3UUY6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Prom2Q3UUY6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Prom2Q3UUY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Prom2Q3UUY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Prom2Q3UUY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Prom2Q3UUY6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Prom2Q3UUY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Prom2Q3UUY6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Prom2Q3UUY6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Prom2Q3UUY6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Prom2Q3UUY6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Prom2Q3UUY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Prom2Q3UUY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Prom2Q3UUY6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Prom2Q3UUY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32,97■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Prom2Q3UUY6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Prom2Q3UUY6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Prom2Q3UUY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Prom2Q3UUY6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Prom2Q3UUY6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Prom2Q3UUY6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Prom2Q3UUY6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Prom2Q3UUY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Prom2Q3UUY6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Prom2Q3UUY6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Prom2Q3UUY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Prom2Q3UUY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Prom2Q3UUY6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Prom2Q3UUY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Prom2Q3UUY6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Prom2Q3UUY6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Prom2Q3UUY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Prom2Q3UUY6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Prom2Q3UUY6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Prom2Q3UUY6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,9 ms