Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx27Q3UHD6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx27Q3UHD6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx27Q3UHD6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snx27Q3UHD6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snx27Q3UHD6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snx27Q3UHD6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx27Q3UHD6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx27Q3UHD6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snx27Q3UHD6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snx27Q3UHD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx27Q3UHD6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx27Q3UHD6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx27Q3UHD6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx27Q3UHD6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx27Q3UHD6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx27Q3UHD6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snx27Q3UHD6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snx27Q3UHD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx27Q3UHD6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx27Q3UHD6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx27Q3UHD6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx27Q3UHD6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snx27Q3UHD6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx27Q3UHD6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx27Q3UHD6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx27Q3UHD6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx27Q3UHD6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snx27Q3UHD6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx27Q3UHD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx27Q3UHD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx27Q3UHD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx27Q3UHD6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx27Q3UHD6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx27Q3UHD6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx27Q3UHD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Snx27Q3UHD6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx27Q3UHD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx27Q3UHD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx27Q3UHD6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx27Q3UHD6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx27Q3UHD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx27Q3UHD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx27Q3UHD6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms