Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Rasip1Q3U0S6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Rasip1Q3U0S6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Rasip1Q3U0S6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Rasip1Q3U0S6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rasip1Q3U0S6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Rasip1Q3U0S6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Rasip1Q3U0S6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rasip1Q3U0S6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rasip1Q3U0S6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Rasip1Q3U0S6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rasip1Q3U0S6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rasip1Q3U0S6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rasip1Q3U0S6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rasip1Q3U0S6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rasip1Q3U0S6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rasip1Q3U0S6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rasip1Q3U0S6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rasip1Q3U0S6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rasip1Q3U0S6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rasip1Q3U0S6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rasip1Q3U0S6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Rasip1Q3U0S6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rasip1Q3U0S6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rasip1Q3U0S6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rasip1Q3U0S6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rasip1Q3U0S6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rasip1Q3U0S6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Rasip1Q3U0S6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Rasip1Q3U0S6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Rasip1Q3U0S6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rasip1Q3U0S6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Rasip1Q3U0S6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Rasip1Q3U0S6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rasip1Q3U0S6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rasip1Q3U0S6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Rasip1Q3U0S6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rasip1Q3U0S6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Rasip1Q3U0S6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,5 ms