Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pip4p1Q3TWL2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pip4p1Q3TWL2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pip4p1Q3TWL2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pip4p1Q3TWL2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pip4p1Q3TWL2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pip4p1Q3TWL2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pip4p1Q3TWL2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pip4p1Q3TWL2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pip4p1Q3TWL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pip4p1Q3TWL2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pip4p1Q3TWL2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pip4p1Q3TWL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pip4p1Q3TWL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pip4p1Q3TWL2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pip4p1Q3TWL2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pip4p1Q3TWL2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4p1Q3TWL2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4p1Q3TWL2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4p1Q3TWL2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4p1Q3TWL2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4p1Q3TWL2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4p1Q3TWL2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pip4p1Q3TWL2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4p1Q3TWL2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4p1Q3TWL2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4p1Q3TWL2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pip4p1Q3TWL2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pip4p1Q3TWL2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pip4p1Q3TWL2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pip4p1Q3TWL2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pip4p1Q3TWL2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pip4p1Q3TWL2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pip4p1Q3TWL2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pip4p1Q3TWL2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pip4p1Q3TWL2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pip4p1Q3TWL2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pip4p1Q3TWL2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pip4p1Q3TWL2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pip4p1Q3TWL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms