Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sppl2bQ3TD49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sppl2bQ3TD49 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sppl2bQ3TD49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sppl2bQ3TD49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sppl2bQ3TD49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sppl2bQ3TD49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sppl2bQ3TD49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sppl2bQ3TD49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sppl2bQ3TD49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sppl2bQ3TD49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sppl2bQ3TD49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sppl2bQ3TD49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sppl2bQ3TD49 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sppl2bQ3TD49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sppl2bQ3TD49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sppl2bQ3TD49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sppl2bQ3TD49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sppl2bQ3TD49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sppl2bQ3TD49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sppl2bQ3TD49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sppl2bQ3TD49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sppl2bQ3TD49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sppl2bQ3TD49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sppl2bQ3TD49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sppl2bQ3TD49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sppl2bQ3TD49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sppl2bQ3TD49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sppl2bQ3TD49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sppl2bQ3TD49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sppl2bQ3TD49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sppl2bQ3TD49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms