Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Defa26Q3L180 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Defa26Q3L180 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Defa26Q3L180 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Defa26Q3L180 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Defa26Q3L180 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Defa26Q3L180 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Defa26Q3L180 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
Defa26Q3L180 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Defa26Q3L180 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Defa26Q3L180 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Defa26Q3L180 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,31■■□□□ 1
Defa26Q3L180 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Defa26Q3L180 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Defa26Q3L180 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Defa26Q3L180 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Defa26Q3L180 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Defa26Q3L180 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Defa26Q3L180 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Defa26Q3L180 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Defa26Q3L180 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Defa26Q3L180 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Defa26Q3L180 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Defa26Q3L180 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Defa26Q3L180 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms