Protein–RNA interactions for Protein: Q2PMX6

Dmrtc1b, DMRT-like family C1b, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmrtc1bQ2PMX6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dmrtc1bQ2PMX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dmrtc1bQ2PMX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dmrtc1bQ2PMX6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dmrtc1bQ2PMX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dmrtc1bQ2PMX6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dmrtc1bQ2PMX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dmrtc1bQ2PMX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dmrtc1bQ2PMX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dmrtc1bQ2PMX6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dmrtc1bQ2PMX6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dmrtc1bQ2PMX6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dmrtc1bQ2PMX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dmrtc1bQ2PMX6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dmrtc1bQ2PMX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dmrtc1bQ2PMX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dmrtc1bQ2PMX6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dmrtc1bQ2PMX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dmrtc1bQ2PMX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms