Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vax1Q2NKI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vax1Q2NKI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vax1Q2NKI2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vax1Q2NKI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vax1Q2NKI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vax1Q2NKI2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vax1Q2NKI2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vax1Q2NKI2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vax1Q2NKI2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vax1Q2NKI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vax1Q2NKI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vax1Q2NKI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vax1Q2NKI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vax1Q2NKI2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vax1Q2NKI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vax1Q2NKI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vax1Q2NKI2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vax1Q2NKI2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vax1Q2NKI2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vax1Q2NKI2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vax1Q2NKI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vax1Q2NKI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vax1Q2NKI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vax1Q2NKI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vax1Q2NKI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms