Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Myo3bQ1EG27 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Myo3bQ1EG27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Myo3bQ1EG27 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Myo3bQ1EG27 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Myo3bQ1EG27 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Myo3bQ1EG27 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Myo3bQ1EG27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,51■■■□□ 2,8
Myo3bQ1EG27 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Myo3bQ1EG27 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Myo3bQ1EG27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Myo3bQ1EG27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Myo3bQ1EG27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Myo3bQ1EG27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Myo3bQ1EG27 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Myo3bQ1EG27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Myo3bQ1EG27 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Myo3bQ1EG27 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Myo3bQ1EG27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Myo3bQ1EG27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Myo3bQ1EG27 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Myo3bQ1EG27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Myo3bQ1EG27 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Myo3bQ1EG27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Myo3bQ1EG27 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Myo3bQ1EG27 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Myo3bQ1EG27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Myo3bQ1EG27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Myo3bQ1EG27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
Myo3bQ1EG27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,06■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,04■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,01■■■□□ 2,72
Myo3bQ1EG27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Myo3bQ1EG27 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Myo3bQ1EG27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,82■■■□□ 2,69
Myo3bQ1EG27 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Myo3bQ1EG27 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Myo3bQ1EG27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Myo3bQ1EG27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Myo3bQ1EG27 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Myo3bQ1EG27 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Myo3bQ1EG27 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
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