Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb8Q0VBD0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb8Q0VBD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb8Q0VBD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb8Q0VBD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb8Q0VBD0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb8Q0VBD0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb8Q0VBD0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb8Q0VBD0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb8Q0VBD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb8Q0VBD0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb8Q0VBD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb8Q0VBD0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb8Q0VBD0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms