Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pglyrp4Q0VB07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pglyrp4Q0VB07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pglyrp4Q0VB07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pglyrp4Q0VB07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pglyrp4Q0VB07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pglyrp4Q0VB07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pglyrp4Q0VB07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms