Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab42Q0PD08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab42Q0PD08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab42Q0PD08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab42Q0PD08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab42Q0PD08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab42Q0PD08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab42Q0PD08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab42Q0PD08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab42Q0PD08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab42Q0PD08 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab42Q0PD08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab42Q0PD08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab42Q0PD08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab42Q0PD08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms