Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Spata18Q0P557 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Spata18Q0P557 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Spata18Q0P557 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Spata18Q0P557 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Spata18Q0P557 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Spata18Q0P557 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Spata18Q0P557 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Spata18Q0P557 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Spata18Q0P557 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Spata18Q0P557 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Spata18Q0P557 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Spata18Q0P557 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Spata18Q0P557 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Spata18Q0P557 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Spata18Q0P557 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Spata18Q0P557 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Spata18Q0P557 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Spata18Q0P557 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Spata18Q0P557 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Spata18Q0P557 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Spata18Q0P557 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spata18Q0P557 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Spata18Q0P557 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Spata18Q0P557 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Spata18Q0P557 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spata18Q0P557 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spata18Q0P557 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Spata18Q0P557 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Spata18Q0P557 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Spata18Q0P557 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Spata18Q0P557 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Spata18Q0P557 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Spata18Q0P557 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Spata18Q0P557 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Spata18Q0P557 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Spata18Q0P557 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Spata18Q0P557 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Spata18Q0P557 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Spata18Q0P557 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Spata18Q0P557 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms