Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Siah1bQ06985 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Siah1bQ06985 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Siah1bQ06985 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Siah1bQ06985 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Siah1bQ06985 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Siah1bQ06985 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Siah1bQ06985 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Siah1bQ06985 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Siah1bQ06985 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Siah1bQ06985 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Siah1bQ06985 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Siah1bQ06985 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Siah1bQ06985 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Siah1bQ06985 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Siah1bQ06985 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Siah1bQ06985 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Siah1bQ06985 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Siah1bQ06985 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Siah1bQ06985 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Siah1bQ06985 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Siah1bQ06985 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Siah1bQ06985 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Siah1bQ06985 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Siah1bQ06985 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Siah1bQ06985 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Siah1bQ06985 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Siah1bQ06985 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Siah1bQ06985 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,39■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Siah1bQ06985 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Siah1bQ06985 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Siah1bQ06985 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Siah1bQ06985 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Siah1bQ06985 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Siah1bQ06985 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Siah1bQ06985 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Siah1bQ06985 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,4 ms