Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp39Q02525 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp39Q02525 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zfp39Q02525 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp39Q02525 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp39Q02525 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp39Q02525 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp39Q02525 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp39Q02525 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp39Q02525 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp39Q02525 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms