Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2cQ01098 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2cQ01098 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2cQ01098 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2cQ01098 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2cQ01098 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2cQ01098 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2cQ01098 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2cQ01098 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2cQ01098 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2cQ01098 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin2cQ01098 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grin2cQ01098 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grin2cQ01098 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grin2cQ01098 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grin2cQ01098 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grin2cQ01098 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Grin2cQ01098 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2cQ01098 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2cQ01098 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2cQ01098 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin2cQ01098 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin2cQ01098 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin2cQ01098 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grin2cQ01098 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2cQ01098 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2cQ01098 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2cQ01098 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2cQ01098 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2cQ01098 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2cQ01098 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2cQ01098 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2cQ01098 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2cQ01098 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2cQ01098 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2cQ01098 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2cQ01098 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2cQ01098 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2cQ01098 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2cQ01098 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2cQ01098 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2cQ01098 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms