Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SeleQ00690 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SeleQ00690 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SeleQ00690 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SeleQ00690 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SeleQ00690 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SeleQ00690 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SeleQ00690 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SeleQ00690 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SeleQ00690 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SeleQ00690 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SeleQ00690 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SeleQ00690 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SeleQ00690 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SeleQ00690 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SeleQ00690 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SeleQ00690 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SeleQ00690 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SeleQ00690 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SeleQ00690 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SeleQ00690 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SeleQ00690 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SeleQ00690 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SeleQ00690 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SeleQ00690 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SeleQ00690 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SeleQ00690 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SeleQ00690 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SeleQ00690 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SeleQ00690 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms