Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Atp11aP98197 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Atp11aP98197 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Atp11aP98197 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Atp11aP98197 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Atp11aP98197 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Atp11aP98197 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Atp11aP98197 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Atp11aP98197 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Atp11aP98197 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Atp11aP98197 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Atp11aP98197 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Atp11aP98197 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Atp11aP98197 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Atp11aP98197 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp11aP98197 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Atp11aP98197 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Atp11aP98197 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atp11aP98197 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atp11aP98197 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Atp11aP98197 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atp11aP98197 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atp11aP98197 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Atp11aP98197 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp11aP98197 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Atp11aP98197 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atp11aP98197 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Atp11aP98197 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atp11aP98197 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Atp11aP98197 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Atp11aP98197 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Atp11aP98197 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Atp11aP98197 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Atp11aP98197 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,64■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Atp11aP98197 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Atp11aP98197 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Atp11aP98197 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atp11aP98197 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atp11aP98197 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp11aP98197 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp11aP98197 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,9 ms