Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
AlkP97793 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
AlkP97793 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
AlkP97793 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
AlkP97793 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
AlkP97793 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
AlkP97793 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
AlkP97793 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
AlkP97793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
AlkP97793 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
AlkP97793 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
AlkP97793 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
AlkP97793 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
AlkP97793 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
AlkP97793 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
AlkP97793 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
AlkP97793 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
AlkP97793 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
AlkP97793 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
AlkP97793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
AlkP97793 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
AlkP97793 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
AlkP97793 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
AlkP97793 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
AlkP97793 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
AlkP97793 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
AlkP97793 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
AlkP97793 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
AlkP97793 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
AlkP97793 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
AlkP97793 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
AlkP97793 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
AlkP97793 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
AlkP97793 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
AlkP97793 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
AlkP97793 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
AlkP97793 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
AlkP97793 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
AlkP97793 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
AlkP97793 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
AlkP97793 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
AlkP97793 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
AlkP97793 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
AlkP97793 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
AlkP97793 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
AlkP97793 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
AlkP97793 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
AlkP97793 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
AlkP97793 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
AlkP97793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
AlkP97793 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
AlkP97793 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
AlkP97793 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
AlkP97793 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
AlkP97793 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
AlkP97793 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
AlkP97793 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
AlkP97793 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
AlkP97793 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
AlkP97793 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
AlkP97793 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
AlkP97793 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
AlkP97793 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
AlkP97793 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
AlkP97793 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
AlkP97793 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
AlkP97793 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
AlkP97793 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
AlkP97793 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
AlkP97793 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
AlkP97793 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
AlkP97793 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
AlkP97793 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
AlkP97793 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
AlkP97793 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
AlkP97793 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
AlkP97793 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
AlkP97793 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
AlkP97793 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
AlkP97793 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
AlkP97793 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
AlkP97793 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
AlkP97793 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
AlkP97793 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
AlkP97793 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
AlkP97793 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
AlkP97793 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
AlkP97793 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
AlkP97793 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
AlkP97793 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
AlkP97793 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
AlkP97793 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
AlkP97793 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
AlkP97793 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
AlkP97793 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
AlkP97793 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
AlkP97793 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
AlkP97793 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
AlkP97793 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
AlkP97793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms