Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl21cP86793 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl21cP86793 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccl21cP86793 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl21cP86793 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccl21cP86793 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccl21cP86793 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccl21cP86793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl21cP86793 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl21cP86793 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl21cP86793 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl21cP86793 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl21cP86793 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl21cP86793 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl21cP86793 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccl21cP86793 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl21cP86793 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl21cP86793 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl21cP86793 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccl21cP86793 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl21cP86793 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl21cP86793 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl21cP86793 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl21cP86793 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl21cP86793 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl21cP86793 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl21cP86793 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl21cP86793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl21cP86793 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl21cP86793 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl21cP86793 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl21cP86793 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccl21cP86793 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl21cP86793 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl21cP86793 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccl21cP86793 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccl21cP86793 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl21cP86793 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl21cP86793 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccl21cP86793 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms