Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1bP70700 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1bP70700 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1bP70700 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr1bP70700 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1bP70700 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1bP70700 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1bP70700 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr1bP70700 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr1bP70700 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1bP70700 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms