Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SeboxP70368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SeboxP70368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SeboxP70368 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SeboxP70368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SeboxP70368 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SeboxP70368 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SeboxP70368 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SeboxP70368 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SeboxP70368 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SeboxP70368 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SeboxP70368 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeboxP70368 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SeboxP70368 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SeboxP70368 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SeboxP70368 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SeboxP70368 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SeboxP70368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeboxP70368 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SeboxP70368 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeboxP70368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SeboxP70368 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SeboxP70368 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SeboxP70368 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms