Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sema3eP70275 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sema3eP70275 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sema3eP70275 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sema3eP70275 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sema3eP70275 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Sema3eP70275 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sema3eP70275 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Sema3eP70275 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sema3eP70275 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sema3eP70275 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sema3eP70275 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Sema3eP70275 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sema3eP70275 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sema3eP70275 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Sema3eP70275 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sema3eP70275 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Sema3eP70275 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Sema3eP70275 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sema3eP70275 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sema3eP70275 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Sema3eP70275 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sema3eP70275 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sema3eP70275 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Sema3eP70275 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,35■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sema3eP70275 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Sema3eP70275 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Sema3eP70275 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Sema3eP70275 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sema3eP70275 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Sema3eP70275 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Sema3eP70275 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Sema3eP70275 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sema3eP70275 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sema3eP70275 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sema3eP70275 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms