Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkn1P70268 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkn1P70268 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pkn1P70268 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkn1P70268 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkn1P70268 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pkn1P70268 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pkn1P70268 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pkn1P70268 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkn1P70268 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkn1P70268 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkn1P70268 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkn1P70268 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pkn1P70268 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkn1P70268 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkn1P70268 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pkn1P70268 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pkn1P70268 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkn1P70268 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pkn1P70268 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pkn1P70268 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkn1P70268 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkn1P70268 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkn1P70268 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkn1P70268 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pkn1P70268 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkn1P70268 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms