Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra1P62812 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra1P62812 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra1P62812 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra1P62812 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabra1P62812 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabra1P62812 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gabra1P62812 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabra1P62812 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabra1P62812 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabra1P62812 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabra1P62812 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabra1P62812 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra1P62812 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms