Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap2s1P62743 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap2s1P62743 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap2s1P62743 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap2s1P62743 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap2s1P62743 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap2s1P62743 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap2s1P62743 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap2s1P62743 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap2s1P62743 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap2s1P62743 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap2s1P62743 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap2s1P62743 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap2s1P62743 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap2s1P62743 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap2s1P62743 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms