Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arpc4P59999 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arpc4P59999 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arpc4P59999 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arpc4P59999 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arpc4P59999 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arpc4P59999 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arpc4P59999 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Arpc4P59999 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arpc4P59999 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arpc4P59999 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arpc4P59999 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arpc4P59999 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arpc4P59999 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arpc4P59999 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arpc4P59999 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms