Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Nphp4P59240 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Nphp4P59240 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Nphp4P59240 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Nphp4P59240 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Nphp4P59240 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Nphp4P59240 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Nphp4P59240 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Nphp4P59240 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nphp4P59240 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nphp4P59240 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Nphp4P59240 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nphp4P59240 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Nphp4P59240 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nphp4P59240 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nphp4P59240 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nphp4P59240 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nphp4P59240 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Nphp4P59240 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Nphp4P59240 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nphp4P59240 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Nphp4P59240 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nphp4P59240 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Nphp4P59240 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Nphp4P59240 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nphp4P59240 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nphp4P59240 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Nphp4P59240 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Nphp4P59240 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nphp4P59240 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Nphp4P59240 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nphp4P59240 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Nphp4P59240 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Nphp4P59240 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nphp4P59240 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nphp4P59240 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nphp4P59240 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nphp4P59240 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nphp4P59240 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nphp4P59240 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nphp4P59240 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nphp4P59240 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Nphp4P59240 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nphp4P59240 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nphp4P59240 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nphp4P59240 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nphp4P59240 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nphp4P59240 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms