Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TdgP56581 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TdgP56581 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TdgP56581 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TdgP56581 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TdgP56581 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TdgP56581 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TdgP56581 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TdgP56581 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TdgP56581 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TdgP56581 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TdgP56581 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TdgP56581 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TdgP56581 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TdgP56581 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TdgP56581 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TdgP56581 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TdgP56581 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TdgP56581 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TdgP56581 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TdgP56581 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TdgP56581 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TdgP56581 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TdgP56581 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TdgP56581 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TdgP56581 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TdgP56581 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TdgP56581 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TdgP56581 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TdgP56581 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TdgP56581 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TdgP56581 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TdgP56581 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TdgP56581 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TdgP56581 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TdgP56581 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TdgP56581 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TdgP56581 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TdgP56581 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TdgP56581 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TdgP56581 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TdgP56581 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TdgP56581 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TdgP56581 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TdgP56581 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TdgP56581 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TdgP56581 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TdgP56581 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TdgP56581 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TdgP56581 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TdgP56581 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TdgP56581 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TdgP56581 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TdgP56581 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TdgP56581 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TdgP56581 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TdgP56581 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TdgP56581 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TdgP56581 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TdgP56581 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TdgP56581 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TdgP56581 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TdgP56581 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TdgP56581 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TdgP56581 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TdgP56581 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TdgP56581 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TdgP56581 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TdgP56581 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TdgP56581 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TdgP56581 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TdgP56581 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TdgP56581 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TdgP56581 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TdgP56581 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TdgP56581 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TdgP56581 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TdgP56581 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TdgP56581 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TdgP56581 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TdgP56581 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TdgP56581 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TdgP56581 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TdgP56581 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TdgP56581 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TdgP56581 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TdgP56581 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TdgP56581 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TdgP56581 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TdgP56581 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TdgP56581 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TdgP56581 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TdgP56581 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TdgP56581 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TdgP56581 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TdgP56581 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TdgP56581 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TdgP56581 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TdgP56581 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TdgP56581 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms