Protein–RNA interactions for Protein: P55821

Stmn2, Stathmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn2P55821 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Stmn2P55821 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Stmn2P55821 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Stmn2P55821 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Stmn2P55821 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Stmn2P55821 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Stmn2P55821 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Stmn2P55821 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Stmn2P55821 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Stmn2P55821 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Stmn2P55821 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Stmn2P55821 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Stmn2P55821 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Stmn2P55821 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Stmn2P55821 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Stmn2P55821 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Stmn2P55821 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Stmn2P55821 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Stmn2P55821 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Stmn2P55821 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Stmn2P55821 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms