Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1P55194 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp1P55194 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp1P55194 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp1P55194 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp1P55194 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp1P55194 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp1P55194 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp1P55194 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3bp1P55194 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp1P55194 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp1P55194 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp1P55194 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1P55194 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp1P55194 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1P55194 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp1P55194 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp1P55194 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp1P55194 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp1P55194 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp1P55194 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bp1P55194 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bp1P55194 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp1P55194 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp1P55194 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bp1P55194 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bp1P55194 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh3bp1P55194 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh3bp1P55194 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh3bp1P55194 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3bp1P55194 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3bp1P55194 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms