Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atxn1P54254 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn1P54254 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn1P54254 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn1P54254 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn1P54254 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atxn1P54254 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atxn1P54254 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn1P54254 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn1P54254 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn1P54254 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atxn1P54254 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn1P54254 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn1P54254 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn1P54254 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn1P54254 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn1P54254 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atxn1P54254 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn1P54254 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn1P54254 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn1P54254 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn1P54254 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn1P54254 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn1P54254 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn1P54254 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn1P54254 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn1P54254 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn1P54254 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atxn1P54254 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn1P54254 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn1P54254 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms