Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Limk1P53668 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Limk1P53668 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Limk1P53668 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Limk1P53668 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Limk1P53668 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Limk1P53668 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Limk1P53668 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Limk1P53668 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Limk1P53668 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Limk1P53668 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk1P53668 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Limk1P53668 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Limk1P53668 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Limk1P53668 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Limk1P53668 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Limk1P53668 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Limk1P53668 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Limk1P53668 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Limk1P53668 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Limk1P53668 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Limk1P53668 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Limk1P53668 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Limk1P53668 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Limk1P53668 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Limk1P53668 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Limk1P53668 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Limk1P53668 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Limk1P53668 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Limk1P53668 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Limk1P53668 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Limk1P53668 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Limk1P53668 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Limk1P53668 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Limk1P53668 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Limk1P53668 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Limk1P53668 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Limk1P53668 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Limk1P53668 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk1P53668 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk1P53668 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Limk1P53668 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Limk1P53668 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk1P53668 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk1P53668 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Limk1P53668 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Limk1P53668 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Limk1P53668 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Limk1P53668 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Limk1P53668 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Limk1P53668 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Limk1P53668 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Limk1P53668 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk1P53668 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Limk1P53668 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms