Protein–RNA interactions for Protein: P51945

Ccng1, Cyclin-G1, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccng1P51945 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccng1P51945 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccng1P51945 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccng1P51945 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccng1P51945 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccng1P51945 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccng1P51945 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccng1P51945 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccng1P51945 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccng1P51945 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccng1P51945 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccng1P51945 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccng1P51945 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccng1P51945 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccng1P51945 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccng1P51945 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccng1P51945 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccng1P51945 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccng1P51945 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms