Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cox8bP48772 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cox8bP48772 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cox8bP48772 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cox8bP48772 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cox8bP48772 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cox8bP48772 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cox8bP48772 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox8bP48772 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox8bP48772 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox8bP48772 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cox8bP48772 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cox8bP48772 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cox8bP48772 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox8bP48772 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms