Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17,03■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Xcl1P47993 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16,99■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16,99■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Xcl1P47993 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16,94■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16,91■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Xcl1P47993 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Xcl1P47993 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16,82■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Xcl1P47993 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Xcl1P47993 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16,66■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Xcl1P47993 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Xcl1P47993 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms