Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stt3aP46978 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stt3aP46978 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stt3aP46978 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stt3aP46978 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stt3aP46978 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stt3aP46978 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stt3aP46978 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stt3aP46978 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stt3aP46978 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stt3aP46978 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stt3aP46978 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stt3aP46978 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stt3aP46978 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stt3aP46978 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stt3aP46978 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stt3aP46978 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stt3aP46978 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stt3aP46978 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stt3aP46978 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stt3aP46978 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms