Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Myo1bP46735 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Myo1bP46735 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Myo1bP46735 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Myo1bP46735 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Myo1bP46735 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Myo1bP46735 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Myo1bP46735 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Myo1bP46735 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Myo1bP46735 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Myo1bP46735 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Myo1bP46735 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Myo1bP46735 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Myo1bP46735 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Myo1bP46735 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Myo1bP46735 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Myo1bP46735 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Myo1bP46735 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Myo1bP46735 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Myo1bP46735 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Myo1bP46735 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Myo1bP46735 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Myo1bP46735 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Myo1bP46735 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Myo1bP46735 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Myo1bP46735 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Myo1bP46735 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Myo1bP46735 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Myo1bP46735 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Myo1bP46735 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Myo1bP46735 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Myo1bP46735 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Myo1bP46735 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Myo1bP46735 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Myo1bP46735 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Myo1bP46735 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Myo1bP46735 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Myo1bP46735 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Myo1bP46735 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Myo1bP46735 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Myo1bP46735 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Myo1bP46735 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,7 ms