Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klf1P46099 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klf1P46099 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klf1P46099 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Klf1P46099 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klf1P46099 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klf1P46099 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Klf1P46099 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klf1P46099 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klf1P46099 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Klf1P46099 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klf1P46099 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klf1P46099 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Klf1P46099 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Klf1P46099 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klf1P46099 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klf1P46099 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klf1P46099 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klf1P46099 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klf1P46099 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klf1P46099 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klf1P46099 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klf1P46099 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Klf1P46099 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klf1P46099 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klf1P46099 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klf1P46099 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klf1P46099 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Klf1P46099 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klf1P46099 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klf1P46099 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klf1P46099 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klf1P46099 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Klf1P46099 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klf1P46099 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klf1P46099 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Klf1P46099 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klf1P46099 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klf1P46099 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klf1P46099 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klf1P46099 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klf1P46099 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klf1P46099 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klf1P46099 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf1P46099 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf1P46099 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klf1P46099 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Klf1P46099 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klf1P46099 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klf1P46099 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klf1P46099 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Klf1P46099 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klf1P46099 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms