Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad52P43352 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad52P43352 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad52P43352 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad52P43352 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad52P43352 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad52P43352 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad52P43352 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad52P43352 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad52P43352 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad52P43352 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad52P43352 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad52P43352 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad52P43352 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad52P43352 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad52P43352 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad52P43352 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad52P43352 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad52P43352 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad52P43352 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad52P43352 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad52P43352 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad52P43352 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad52P43352 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad52P43352 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad52P43352 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad52P43352 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad52P43352 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad52P43352 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad52P43352 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad52P43352 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad52P43352 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad52P43352 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad52P43352 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad52P43352 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad52P43352 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms