Protein–RNA interactions for Protein: P42866

Oprm1, Mu-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprm1P42866 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms