Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Hmx3P42581 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
Hmx3P42581 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Hmx3P42581 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Hmx3P42581 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Hmx3P42581 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Hmx3P42581 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Hmx3P42581 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Hmx3P42581 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Hmx3P42581 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Hmx3P42581 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Hmx3P42581 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64,4 ms