Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pola1P33609 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pola1P33609 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pola1P33609 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pola1P33609 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pola1P33609 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pola1P33609 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pola1P33609 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pola1P33609 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pola1P33609 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pola1P33609 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Pola1P33609 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pola1P33609 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pola1P33609 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pola1P33609 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pola1P33609 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pola1P33609 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pola1P33609 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pola1P33609 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pola1P33609 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pola1P33609 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pola1P33609 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pola1P33609 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pola1P33609 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pola1P33609 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pola1P33609 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pola1P33609 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pola1P33609 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pola1P33609 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pola1P33609 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pola1P33609 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pola1P33609 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pola1P33609 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pola1P33609 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pola1P33609 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pola1P33609 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pola1P33609 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pola1P33609 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pola1P33609 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pola1P33609 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pola1P33609 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pola1P33609 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pola1P33609 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pola1P33609 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pola1P33609 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pola1P33609 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pola1P33609 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pola1P33609 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pola1P33609 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pola1P33609 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pola1P33609 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pola1P33609 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pola1P33609 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pola1P33609 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pola1P33609 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Pola1P33609 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Pola1P33609 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pola1P33609 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Pola1P33609 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pola1P33609 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pola1P33609 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pola1P33609 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pola1P33609 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pola1P33609 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pola1P33609 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms